LabDAO kortlægger fremtiden for open source AI til lægemiddelopdagelse

Folding@home-projektet skabte overskrifter under hele COVID-19-pandemien for at samle ubrugt computerkraft for at udforske proteinfoldningssøgerummet for at tackle den nye coronavirus. Initiativet gav borgerne mulighed for at være videnskabsmænd i deres egen ret og kørte simuleringer i stor skala af forskellige molekylære konfigurationer af proteiner på tværs af et distribueret netværk af "tilmeldte" computere over hele verden.

Dette decentraliserede paradigme blev indvarslet for at bringe mennesker sammen omkring et fælles problem og effektivt crowd-sourcing computerkraft, men hvad nu hvis computerkraften og problemløsningsinfrastrukturen var omvendt? Med andre ord, hvad nu hvis enkeltpersoner kunne køre deres egne projekter ved at udnytte akkumuleret computerkraft , redskaberne til biologiske eksperimenter til at starte?

LabDAO gør den drøm til virkelighed med sin PLEX-platform. PLEX er et open source-kommandolinjeværktøj designet til at gøre ikke kun computerressourcer, men også en række biologiske maskinlæringsværktøjer (opfundet "BioML"-pakken i LabDAO) tilgængelige på tværs af en række forskellige baggrunde. Uanset om man eksperimenterer med små molekyle docking eller proteinfoldningssimuleringer af sine egne, giver PLEX brugere mulighed for at benytte sig af LabDAOs bibliotek af værktøjer, dele resultater og visualisere dem på mindre end fem minutter.

Denne suite af værktøjer og dens brugsaktiverende platform oven på den blev vist på Zuzalu's Blockchain Meets Biology-topmøde i begyndelsen af ​​april, hvor LabDAO Core Team-medlem Lily Hansen-Gillis demonstrerede fra start til slut en simulering af intern molekylær dynamik i en protein for at finde sin mest stabile konfiguration. Derefter, som en selverklæret "ikke-koder", ledte hun publikum gennem det fra start til slut - alt sammen med en computer, WiFi, PLEX på kommandolinjen og intet mere.

Mere generelt er LabDAO en web3-aktiveret decentral platform (en del af den større "DeSci"-bevægelse), der er forpligtet til at skabe et mere produktivt miljø for open source-drevet lægemiddelopdagelse. Ved at gøre værktøjer og ressourcer på forkant tilgængelige for et bredere økosystem, sigter LabDAO mod at skabe det rette miljø for gennemsigtige og tilgængelige videnskabelige fremskridt. Uanset om det er ved at eliminere behovet for, at forskere skal have deres egen hardware eller computerinfrastruktur eller at offentliggøre resultater af eksperimenter på en blockchain-reskontro, så de er håndterbare og reproducerbare, er organisationen forpligtet til at gøre mere innovation mulig gennem samarbejde - at nedbryde barrierer forårsaget af dårlige brugervenlighed og nicheekspertise.

LabDAO's bestræbelser på at bygge denne DeSci-verden for i dag fik for nylig et løft i form af en finansieringsrunde på $3.6 millioner fra forskellige andre DAO'er, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan og andre. Denne tilstrømning af støtte vil bidrage til den igangværende indsats for at opbygge open source softwareværktøjer og styrke LabDAOs forskningsøkosystem.

Hvad angår PLEX selv, omfatter de umiddelbare næste trin i horisonten at teste platformen i forskellige videnskabelige samarbejder, containerisering af forskellige værktøjer og akkumulering af den nødvendige hardware til at fremme BioML-netværket.

Hvad angår det langsigtede, vil måske det næste livreddende lægemiddel under det næste store infektionssygdomsudbrud blive designet med kraften fra PLEX, et decentraliseret skridt fremad ad gangen. Mens økosystemet fortsætter med at vokse, vil kun tiden vise.

Tak til Aishani Aatresh for yderligere forskning og rapportering om denne artikel. Jeg er grundlæggeren af ​​SynBioBeta, og nogle af de virksomheder, jeg skriver om, er sponsorer af SynBioBeta-konference. For mere indhold kan du abonnere på mit ugentlige nyhedsbrev.